3.El gen OPN1LW

Com has observat, les opsines tenen un paper molt rellevant en la percepció dels colors.

A partir d’ara ens centrarem en l’estudi bioinformàtic del gen OPN1LW, responsable de produir l’opsina sensible a longituds d’ona llarga (L) i que ens permet percebre el color vermell.

Utilitzarem una base de dades molt interessant que conté molta informació sobre els gens:

GeneCards: http://www.genecards.org

  • Visita GeneCards i busca informació sobre les opsines: escriu opsin a la barra de cerca.
  • Trobaràs més d’un gen relacionat amb les opsines. Clica sobre el gen OPN1LW.
  • Ves a l’apartat de Genomic View i respon:
    • En quin cromosoma es troba?
    • Es troba en el braç petit o llarg del cromosoma?
    • Quina és la posició que ocupa? (Segons la darrera versió del genoma humà GRCh38/hg38)
    • Quina és la mida del gen?

 

Ara ja sabem la informació essencial sobre el gen així que a continuació buscarem informació relacionada amb l’estructura proteica.

  • Ves a l’apartat proteins i indica quina és la mida de la proteïna.
  • Si cada 3 nucleòtids (1 codó) codifiquen per un aminoàcid, quina és la longitud de la seqüència codificant (CDS, coding sequence) d’aquest gen?
  • Com pots veure, només una petita part dels nucleòtids d’un gen s’acaben codificant per proteïna. En aquest cas, quin és el percentatge de nucleòtids que codifiquen respecte al nombre total de nucleòtids del gen?

 

Segueix amb l’activitat: 4. Mutacions al gen OPN1LW

o torna a la pàgina anterior.