La línia de recerca en Bioquímica computacional del grup de recerca BI-Squared, dirigida per Jordi Villà i Mireia Olivella, va estar àmpliament representada al XV Symposium on Bioinformatics (JBI2025), celebrat a Madrid els passats 22-24 d’Octubre. El congrés, organitzat per la Red Española de Bioinformática, és una cita clau per als investigadors del camp. En aquesta edició, la FCTE va presentar-hi diverses comunicacions: Gabriel Ruiz i Roger Casals hi van presentar xerrades orals, mentre que Sergi Soldevila, Jing Yang i Martin Floor (exdoctorand del grup i actual investigador postdoctoral al Barcelona Supercomputing Center) van contribuir-hi amb pòsters científics.
Roger Casals va exposar els resultats més recents del seu treball de doctorat, centrat en la inferència de xarxes gèniques a partir de dades transcriptòmica, per construir models predictius que expliquin com es regulen les transicions entre diferents estats cel·lulars. Per la seva banda, Gabriel Ruiz, va participar amb una short talk on va presentar HomolVar, la nova eina predictiva de patogenicitat per a variants de tipus missense, publicada recentment com a part del seu doctorat. A més, Sergi Soldevila, va presentar un pòster dedicat a l’anàlisi computacional de l’estratificació de variants del gen GRIN, introduint un algoritme computacional per predir la patogenicitat i anotacions funcionals de variants GRIN. Disponible a: GrinDB https://rarevariants.org/grindb/ . Jing Yang va presentar un pòster titulat Standard-of-care therapy induces transcriptional reprogramming of non-malignant oligodendrocytes in glioblastoma, que aporta una nova perspectiva sobre els rols biològics, fins ara poc explorats, dels oligodendròcits en el microambient tumoral. El grup va comptar també amb la participació indirecta de Martin Floor, el treball del qual, amb la col·laboració de Joan Bertran, va ser presentat pel seu director Jordi Villà. En aquesta contribució es va mostrar com a partir d’un protocol de bioquímica computacional es va aconseguir revelar una interfície d’interacció d’IκBα per a la unió tant de NF-κB com d’histones, i residus concrets en IκBα que han permès la generació de mutants amb separació de les dues funcions.
La participació al JBI2025 va oferir una valuosa oportunitat per compartir resultats, establir col·laboracions i conèixer les darreres tendències en bioinformàtica.Les diferents participacions van ser finançades pel Departament de Biociències de la FCTE i el grup de recerca BI-Squared (Roger Casals, Jing Yang, Sergi Soldevila i Gabriel Ruiz), així com per l’IRIS-CC (Roger Casals i Jordi Villà).