Els professors Jordi Villà-Freixa i Joan Bertran, de la Facultat de Ciències, Tecnologia i Enginyeries de la UVic-UCC, han participat en una nova publicació a la prestigiosa revista Cell Reports. També hi ha col·laborat Martin Floor, doctorat a la UVic-UCC.
L’estudi, titulat “Separation-of-function mutants reveal the NF-κB-independent involvement of IκBα in the regulation of intestinal stemness”, aporta una nova visió sobre una proteïna molt coneguda: IκBα.
Una funció inesperada dins el nucli cel·lular
Durant dècades, IκBα s’ha considerat el principal inhibidor de la via NF-κB, essencial per controlar la inflamació i les respostes immunitàries. Aquesta nova recerca, però, demostra que IκBα té una funció addicional dins del nucli cel·lular. En aquest entorn, regula gens implicats en la identitat i diferenciació de les cèl·lules mare intestinals.
Una eina innovadora: FEEC
Per dur a terme l’estudi, l’equip ha utilitzat una eina computacional innovadora: la mètrica Fold-Excluded Evolutionary Conservation (FEEC). Aquesta eina va ser desenvolupada per Martin Floor durant el seu doctorat al Computational Biochemistry and Biophysics Lab (CBBL) de la UVic-UCC.
La FEEC permet identificar regions d’una proteïna que són evolutivament conservades més enllà del que explicaria la seva estructura tridimensional. Això pot indicar funcions reguladores ocultes.
Mutants amb funcions separades
Amb aquestes dades, els investigadors van generar mutants de separació de funció (SOF). Aquests mutants conserven només una de les dues funcions d’IκBα: la clàssica o la nova funció nuclear.
Els experiments van demostrar que la forma nuclear d’IκBα és essencial per mantenir la capacitat de les cèl·lules mare intestinals de diferenciar-se correctament.
Aquest descobriment redefineix IκBα com una peça clau en la regulació epigenètica, amb implicacions en inflamació, càncer i regeneració tissular.
Els propers passos se centraran en validar la metodologia FEEC a escala global. L’objectiu és explorar el Protein Data Bank per identificar altres proteïnes amb funcions dobles similars.
Aquesta recerca representa una fita important en la comprensió dels mecanismes moleculars que connecten el sistema immunitari, la regulació gènica i la regeneració dels teixits. També consolida la presència de la UVic-UCC en projectes de recerca biomèdica d’abast internacional.
